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PG电子解析噬菌体免疫沉淀测序技术(PhIP-seq)推动抗体组研究进展

来源:诸葛清军 日期:2025-03-28

噬菌体免疫沉淀测序技术(Phage immunoprecipitation sequencing,PhIP-seq)作为近年来崭露头角的高通量筛选手段,通过高容量噬菌体展示多肽库、抗体免疫沉淀及高通量测序,实现了基于抗原-抗体匹配的全面抗体库分析。这项技术不仅具有极高的灵敏度,还能够高效检测抗体与多肽的结合。通过深入研究结合位点,阐明抗体与靶标间的相互作用机制,这使得PhIP-seq在自身抗体研究、感染性疾病相关抗体及疫苗研发等多个生物医学领域展现出重要的应用价值。

PG电子解析噬菌体免疫沉淀测序技术(PhIP-seq)推动抗体组研究进展

最近,来自荷兰格罗宁根大学的研究团队在权威免疫学期刊Immunity上发表了两篇重要成果,运用噬菌体免疫沉淀测序技术深入探讨了人血清中的抗体库组成,并识别出炎症性肠病(IBD)的特征抗体标志物。这两篇文章采用相同的噬菌体展示肽库,对超过1000例血清样本进行了筛选和分析,涉及344,000条多肽,这些多肽的蛋白来源于微生物(如肠道微生物、益生菌和致病菌等)、致病因子数据库(VFDB)及免疫表位数据库(IEDB)。每条多肽的长度为64个氨基酸,相邻肽之间有20个氨基酸的重叠部分。

第一篇文章专注于炎症性肠病(包括克罗恩病和溃疡性结肠炎)相关的抗体组分析。研究者利用高通量的PhIP-seq技术,比较了497例IBD患者与1326名对照者的血清抗体,发现IBD患者的抗体表位谱与健康对照存在显著差异,识别到373种IBD相关的差异表达抗体(其中202种抗体过度表达,171种抗体低表达),17%的抗体在IBD的两种形式中均表现存在,而55%仅在克罗恩病中,28%则仅在溃疡性结肠炎中出现。这表明这些多肽具有一定的共线性,可能代表共同的抗体识别区域或结构域。

进一步地,研究评估了这些多肽与患者临床特征间的相关性,发现其与疾病活动度、炎症指标及并发症有明显关系,提示其对应的抗体可能源于发病前的遗传易感性,并在发病后被激活或重新定向。接下来,作者选取了一小部分差异化的肽段,通过递归特征消除(RFE)建立并优化了模型,从而有效区分IBD与对照样本。经过拟合,抗体表位谱能够准确识别克罗恩病患者(AUC=0.89),即使仅使用10个抗体也能达到较高的准确性(AUC=0.87),表明这些特异性多肽可作为IBD的潜在诊断标志。

PhIP-seq技术为解决复杂免疫学议题提供了强有力的工具,同时,凭借其高效的抗体库分析能力,将对生物医学研究特别是在炎症性疾病的早期诊断和治疗中产生深远的影响。在这个不断发展的领域,结合PG电子品牌的专业背景和技术支持,期待未来能够创造更多突破性成果,为医学界和广大患者带来新的希望。

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